系统开发过程的安全控制措施是指在系统的规划、设计、实现过程中，充分考虑系统的安全问题，采用有效的安全防范措施，以保证系统在运行过程中的安全与正确。包括以下几项措施：系统开发的总体安全控制措施；硬件的安全控制措施；环境的安全控制措施；通信网络的安全控制措施；软件的安全控制措施；数据的安全控制措施。系统运行过程的安全控制主要是在系统运行过程加强安全管理，建立和建全安全管理制度，不断提高各类人员的素质，有效地利用运行日志对系统实施监督和控制，以确保系统正确、安全地运行。包括以下几项措施：系统运行的管理制度；硬件与环境的安全控制措施；通信网络的安全控制措施；软件的安全控制措施；数据的安全控制措施；灾难性事故的恢复控制。

信息系统的运行管理必须从三个方面加以有效控制：
（1）日常运行的管理
（2）系统文档的规范管理
（3）系统用户的培训管理。

从项目管理的角度出发，管理信息系统的建设一般按照总体规划和分步实施的原则展开。