组织文化同样存在反面效应。
（1）组织文化的反面效应首先表现在思维方式的同质化上，即当企业内部形成同质化的思维方式后，就会丧失在变化面前的反应能力，就会压制不同意见、压制多样化、反对不同的思维方式，导致大家都只能做出同样反应，从而对市场、技术、产品等方面的变化置若罔闻，丧失时机。它同时会压抑个性，压抑个人的创造性，挫伤个人的努力热情。
（2）组织文化的同质化思维方式的另一种后果是陷入一种偏执的境地，形成一种自我保存本能。这类似于个人较顽固、偏激的思维方式，总以为自己是正确的，不到最后关头不承认自己的偏颇和失误。特别是经历了上一阶段成功的组织，更易陷入这种境地。我们常说“失败是成功之母”，有些时候，“成功也是失败之母”。