（1）这是由管理中心的性质决定的。管理中心是当地人民政府批准设立，受政府委托依法管理住房公积金的独立事业单位。由于管理中心履行政府赋予的行政职能，负责住房公积金的归集、支付、核算和编制使用计划等工作，因此决定了管理中心必须实行独立核算。
（2）建立住房公积金制度有利于提高职工购、建住房能力，促进住房建设，促进政策性抵押贷款制度的建立。考虑到中低收入家庭的经济承受力就必须对住房公积金存贷款利率采取“低进低出”的原则，不能一味追求管理中心的经营效益即以营利为目的。
（3）以维护住房公积金缴存人的合法权益为目的。管理中心通过运用职工缴存的住房公积金而产生的利息收入，除支付职工正常的缴存利息、受托银行承办金融业务的手续费和管理中心的人员经费外，未经住房公积金管理委员会批准不得支付其他费用，独立核算的目的在于本着取之于民、用之于民的原则，保证专款专用，不得挪作他用。

根据国务院《住房公积金管理条例》第三条规定，职工个人缴存的住房公积金和职工单位为职工缴存的住房公积金属于职工个人所有。