组织管理形式一般采取以县（市）为单位进行统筹，条件不具备的地方，在起步阶段也可采取以乡（镇）为单位进行统筹，逐步向县（市）统筹过渡。各级卫生行政部门设立专门的农村医疗管理机构，原则上不增加编制。县级人民成立由有关部门和参加医疗的农民代表组成的农村合作医疗管理委员会，负责有关组织、协调、管理和指导工作。委员会下设经办机构，负责具体业务工作，人员由县级人民调剂解决。根据需要在乡（镇）可设立派出机构（人员）或委托有关机构管理。经办机构人员经费和工作经费列入同级财政预算，不得从农村合作医疗基金中提取。