学校的收费按照四川省人民《关于坚决治理农村中小学乱收费的通知》（川府发[2001]20号）的规定，必须及时足额缴入同级财政专户，实行“收支两条线”管理，并按照批准的预算安排使用。其中属于学校按规定收取的学、杂费，全部用于学校公用经费开支，不得挪作他用；属于学校代收的学生课本费，根据省财政厅、监察厅、教育厅、法制局、物价局的规定，不纳入财政专户管理，不进入“零基预算”，由学校直接用于购买书本或为学生服务的专项开支，定期向学生按实结算。地方各级人民和任何部门都不得截流、平调、统筹和挪用中小学收费资金。学校除按规定标准收费外，不得再向学生收取任何费用。任何机关、部门和单位不得向学校乱摊派收费，更不准搭车收费。对巧立名目或自行提高收费标准乱收费的，各级教育、物价、财政部门要严肃查处，对违反规定的，追究有关责任人员的行政责任。

农村税费改革后，农村义务教育实行“在国务院领导下，由地方负责，分级管理、以县为主”的体制。