船舶电网短路保护的原则最主要的是：应该具有较好的选择性，以保证既准确切除短路故障点，又不造成不必要的大范围停电。此外，短路保护还可考虑避开设备同时工作的大电流冲击而造成的干扰。
船舶电网短路保护动作值的整定原则主要有：
①、按时间原则的整定，主要由万能式自动空气断路器和熔断器来实现，保护装置整定的动作时间朝发电机方向逐级增大；
②、按电流原则的整定，主要由装置式自动空气断路器来实现，整定的动作电流值朝发电机方向逐级增大。