港口保税仓储企业的业务主要包括三个方面：进口分拨、转口贸易和收购出口（一般出口）。
进口分拨业务。进口分拨包括进口保税分拨和出口聚集分运。进口保税分拨是先从国际市场批量进货，经海关备案后运入保税区，在保税区保税仓储，根据市场行情分批报关进口。出口聚集分运是先将中国国内货物报关出口至保税区，并聚集仓储，然后根据国外客户订单情况及时分运出境。
转口贸易。转口贸易是在国际市场价格较低时买进货物，经海关备案后进入保税区内进行仓储，或利用保税区劳动力成本较低的优势进行适当加工，待国际市场行情看好或产品升值后再售往国际市场。
收购出口（一般出口）。收购出口（一般出口）是在中国国内厂家或批发商处收购货物，向保税区海关报关后进入保税区进行仓储，然后根据国外客户订单要求分运出口。