蜜柑大实蝇主要为害甜橙、酸橙、红桔、温州蜜柑等柑桔类植物果实。雌成虫产卵于果实内，卵孵化出幼虫在果实内取食瓤瓣为害，致使果实未熟先黄，未熟先落，丧失食用价值。
主要防治措施：
（1）加强检疫。加强果实、苗木检疫，防止该虫向未发生区扩散。
（2）农业防治。①冬季清园翻耕，消灭地表耕作层的部分越冬蛹；②9月下旬至11月中旬，摘除未熟先黄果，拾净落地果进行集中煮沸、深埋处理，消灭果实中幼虫；③零星、分散的果树，待7～8月成虫产卵后将所有青果全部摘完，使果实中的幼虫不能发育成熟，达到断代的目的；对品种老化、品质低劣的果园，可进行高接换种或砍伐后重新改造果园。
（3）诱杀防治。利用蜜柑大实蝇成虫产卵前有取食补充营养（趋糖性）的生活习性，可用糖酒醋敌百虫液或专用诱剂诱杀成虫。