为确保农产品质量安全管理的各项规定落实到位，《农产品质量安全法》根据国际通行做法和中国农产品质量安全工作实际，在法中设立了一系列的监管制度，包括各级政府及其农业部门以及其他相关职能部门配合的管理体制、农产品质量安全信息发布制度、农产品生产记录制度、农产品包装与标识制度、农产品质量安全市场准入制度、农产品质量安全监测和监督检查制度、农产品质量安全事故报告制度和农产品质量安全责任追究制度等。

对经过认证或检测，符合质量卫生安全指标要求的农产品，准许进入市场经营，对未经认证或检测不合格的农产品市场不准经营销售。