（1）立法机关监督。按规定，临时参议院和国务院对总统。国务员是有质询、建议和弹刻权的。在实践中，民初也曾对政府实施过监督的。
（2）司法机关的监督，北洋军阀政府的司法机关为两个系统，一是普通司法机关，一是专门行政诉讼机关。
（3）审计机关的监督。袁世凯时，即已设立审计处，后又设立“审计院”。