植物根际微生物是指处于植物根际这个特殊生态环境中的微生物区系。

植物根际是指在植物根系影响下的特殊生态环境，一般指距根表2mm以内的土壤范围称为根际。

根土比是指单位植物根际土壤中微生物数量与邻近单位根外土壤中微生物数量之比。