层次结构的个部分本身就是稳定的系统。因为系统中许多相干性关系都造成稳定状态的出现。但这种稳定性随时会受到涨落的影响，由此可产生不稳定、渐进稳定和稳定状态三种情况。不稳定状态在现实中也很难观察到，而渐进稳定状态和稳定状态，能在一定范围内收敛涨落或把涨落限制在许可的范围内。由它们所表征的系统属于稳定系统。当然，稳定系统并不是不变的系统，只要变化本身保持不变，系统就是稳定的。
层次结构的特点决定了它具有更加稳定的机构。在层次结构中个层的结合度彼此不同，其一般趋势是，随着层级有低到高推进，结合度也由大到小递减。这也意味着上层系统存在的范围较下层子系统狭小，或者说低层系统结合度大一些，它们可以存在于高层系统之前，成为孕育高层系统的稳定中间形态，即使在高层系统解体的情况下，低层子系统的稳定性也不一定丧失，有可能在稳定的低层子系统的基础上重新建立新的构型，出现构型变化过程中的稳定转变。