狭义的生物肥料，即指微生物（细菌）肥料，简称菌肥，又称微生物接种剂。它是由具有特殊效能的微生物经过发酵（人工培制）而成的，含有大量有益微生物，施入土壤后，或能固定空气中的氮素，或能活化土壤中的养分，改善植物的营养环璄，或在微生物的生命活动中，产生活性物质，刺激植物生长的特定微生物制品。广义的生物肥料泛指利用生物技术制造的、对作物具有特定肥效（或有肥效又有刺激作用）的生物制剂，其有效成分可以是特定的活生物体、生物的代谢物、或基质的转化物等，这种生物体可以是微生物，也可以是动、植物组织和细胞。生物肥料和化学肥料、有机肥料一样，是农业生产中的重要肥源。近年来，由于大量化学肥料和化学农药的大量不合理施用，不仅耗费了大量不可再生资源，而且破坏了土壤结构，污染了农产品品质和环境，影响人类的健康生存。因此，从现代农业生产中倡导的绿色农业，生态农业发展的趋势看，不污染环境的无公害生物肥料，必将会在未来农业生产中发挥重要的作用。