由于细菌芽孢比大肠杆菌对温度的抵抗力大得多。故发酵罐然芽孢杆菌后不易杀灭，在罐垢层中的芽孢杆菌更不易溶出杀灭，加入稀碱水浸煮后，可将芽孢杆菌在罐垢层中溶出，使芽孢破裂，然后在加热灭菌便易被杀灭。

最佳的灭菌方案是指即能达到无菌要求又有尽量减少消毒液成分的破坏。