抗生素是菌丝体生物合成的次级代谢产物，菌丝体的存在及数量是产生抗生素的基础条件，菌丝生长到对数生长期末，发酵转向抗生素合成期，细胞内开始合成抗生素。菌体生长发展到平衡期，抗生素大量合成。菌丝发育呈衰老自溶期，抗生素合成减缓或停止，这是菌丝发育周期的变化情况。菌丝形态对环境条件的变化特别敏感，菌丝受环境影响出现畸形会降低抗生素合成与分泌，如果出现菌丝阶段逆转，变向年轻，也会影响抗生素合成。有时中期补料较多，或补磷浓度高，糖代谢加快，转向初级代谢，新生菌丝增多，发酵单位反而增长缓慢，甚至停止增长。