《1861—1863年经济学手稿》的写成，表明马克思主义政治经济学的创立过程跨入了一个新的发展阶段。它不仅在理论的结构体系上更趋于成熟，而且对政治经济学原理做出了一系列新的贡献。主要是：
（1）在这部手稿中，马克思全面剖析了劳动力商品的特胜，并抛弃了最低工资的观点，完成了劳动力商品学说的创立；
（2）进一步阐述了剩余价值理论，在相对剩余价值的研究中第一次详细地考察了协作、分工和机器大生产的各个阶段，特别强调了科学技术在社会发展中的重大作用，并且指出机器的资本主义使用，必然使工人阶级和资产阶级之间的矛盾和对立日益加深；
（3）提出了劳动在形式上和实际上从属于资本的论点；
（4）详细地阐述了资本主义条件下生产劳动和非生产劳动理论，并作了科学划分的规定；
（5）论述了资本积累的原始积累理论；
（6）在考察魁奈《经济表》和批判“斯密教条”的基础上第一次系统地阐述了社会再生产理论，并论述了经济危机理论；
（7）第一次详细地提出了平均利润和生产价格理论；
（8）在生产价格理论的基础上论述了绝对地租理论并进一步完善了级差地租理论；
（9）广泛地阐述了商业资本和货币资本的理论，以及它们的特殊增殖条件；
（10）在进一步阐明剩余价值一般的同时还研究了剩余价值的各种转化形式及其在各统治集团之间分配的一般规律，从而完成了广义的剩余价值理论。
（11）不仅如此，这部手稿所包含的理论历史部分的考察，即“剩余价值理论”部分，乃是构成《资本论》第4卷的惟一手稿，从而使马克思最终形成了未来《资本论》的四卷结构。因此，在《1861一1863年经济学手稿》中，马克思已基本上把《资本论》作为一个完整的体系加以论述，而且《资本论》全书的结构体系在纲目上都已大体确定了。以后《资本论》的写作，基本上就是按照这个结构体系来安排的。