正常菌群、宿主与外界环境之间以及正常菌群各成员之间，在正常情况下处于动态平衡状态。一旦这种平衡被打破，正常菌群的组成和数量发生明显变化就出现了菌群失调，若进一步发展引起一系列临床症状和体症，就称之为菌群失调症。机制有：
（1）长期使用抗生素，特别是长期使用广谱看抗生素，在抑制致病菌的同时也抑制了正常菌群中的敏感菌，使耐药菌过度增殖，出现菌群失调。
（2）机体免疫力低下或内分泌失调：恶性肿瘤、长期糖尿病等疾病使全身或局部免疫功能低下，导致正常菌群中某些菌过度生长，形成菌群失调。

正常菌群之间的数量和组成发生明显的改变即为菌群失调，多见于长期使用抗生素。

杀灭物体上病原微生物但不一定杀死细菌芽胞的方法，如注射使用的酒精。

（1）缺乏Eh高的呼吸酶系统。
（2）厌氧菌缺乏解毒用的超氧歧化酶、触酶和过氧化物酶，因超氧、过氧化氢酶有杀菌作用。