都是商标权终止的法定情形，都由商标主管机关收缴其商标注册证，并予以公告，其商标权即告终止。
区别是：注销是当事人自动终止其商标权，商标权从注销公告之日起终止，之前的商标权是有效的。撤消是有关机关采取强制手段终止其商标权，发生争议撤消和不当注册撤消时，商标权视为自始不存在；发生违法撤消时，从撤消之日起终止其商标权。