二沉池主要是用来分离好氧池出来的泥水混合液，好氧池出水经管道自流进入二沉池中心管，在二沉池进行泥水分离。二沉池出水经自流管道流到回流水井，多余水流到后混凝沉淀系统的混合反应池。
二沉池分离出来的活性污泥经管道自流到回流污泥井，活性污泥经回炉污泥泵提升后，大部分作为回流污泥送回好氧池循环使用，剩余部分作为生化过程产生的剩余污泥，送污泥浓缩池中进一步浓缩处理。