（1）分析品种来源及亲缘关系：亲子鉴定、亲缘关系、杂种优势预测，；
（2）某些经济性状的间接选择及疾病的预防；
（3）选择抗病品；
（4）估测育成的新品种中不同品种的参与程度。

广义指家养的驯化动物，狭义指属于哺乳纲的驯化动物

一个群体内所有参与下一世代形成过程的雌雄个体的总合。有效群体越小，近交系数越大。

指品种内具有了一些本品种不应该具有的基因或遗传物质，使品种表现出非本品种固有的性状和性能，同时，也降低了品种的生产性能。

指生产上利用的遗传基础基本相同、基因基本纯合的品种。水产养殖上的纯系品种有两大类：雌核发育、高度近交。

指品种的繁育群体大，以随机方式进行繁殖后代的品种，群体内多个个体的遗传基础具有杂合性。

就是寻找与目的的基因紧密连锁的遗传标记并确定其在染色体上的位置，高密度遗传连锁图的建立使目的基因的定位更为方便。

同一基因座上的不同等位基因编码的同工酶。

在经典遗传学中，是指等位基因的变（差）异；在现代遗传学中，是指基因组中任何座位上的相对差异或者是DNA序列的差异。