一种进化单位；特别地，指被观察的对象中每100个残基发生一个替换所需要的平均进化时间。

指与一组生物体很少相关的一个物种或一组物种。

那些具有相似性的序列，由于物种形成事件而使得它们从一个祖先序列独立进化。

用来评估一系列新空位的罚分；序列比对中空位罚分的一部分。

原核生物调控蛋白结合的与基因启动子相关的一段核苷酸序列。

可以使氨基酸发生变化的密码子中核苷酸的替换。

突变总是导致蛋白质氨基酸序列发生替换的密码子位置。

不影响生物适应性的突变。

一种可以通过学习来仿效一些神经元的功能计算机程序；能够用来根据统计相似性预测数据集的特定属性。

核酸分子的基本单位，其组成方式为碱基-戊糖-磷酸。

一种聚类方法，在聚类之前，所有对象以单个节点表示，然后逐步合并相邻节点。