氨的清除主要是在肝脏经鸟氨酸循环合成尿素，再经肾排出体外。通常每生成1mmol(克分子)的尿素能清除2mol的氨，同时也消耗3mol的ATP，此外，还需多种酶参与完成尿素的合成。肝功能严重障碍时，ATP供给不足和肝内各种酶系统严重受损，故尿素合成减少而导致氨清除不足。

在正常机体内，氨的生成和清除总是保持着动态平衡。但肝性脑病时，既可因其清除不足，也可因氨的生成过多而使血氨升高。

肝性脑病是继发于严重肝病的神经精神综合征。