H.BV感染后，临床表现是多种多样的，常见的有无症状的感染（亚临床感染）、病情轻重不一的急性感染，以及伴有或不伴有慢性的持续感染。
急性HBV感染的临床过程类似于甲型、丙型、戊型肝炎，但发病可能比甲肝更具隐匿性。急性HBV感染典型的临床表现为轻度发热，伴有不适、头疼、肌肉痛、食欲不振、恶心、呕吐、轻度腹泻、右上腹疼痛。黄疸出现前一至数日，尿呈棕色，眼结膜和口腔粘膜黄染，并持续几天至几个星期，黄疸初期有轻微而短暂的皮肤瘙痒。此外，病人肝脏肿大，且有触痛，1/4的病人可触及肿大的脾脏，严重的乙肝患者会出现腹水。
慢性肝炎是指持续的肝炎症状态伴有丙氨酸转氨酶升高超过6个月的患者，慢性肝炎有三种不同的临床类型：
（1）慢性迁延性肝炎，它是一种比较温和的肝炎，发病前可能有急性肝炎的病史，也可能是隐匿的。约50%的病人无症状，其他病人有明显的非特异性症状，如疲倦和肝区疼痛，也可能出现黄疸和肝肿大，转氨酶升高，但不超过正常值的5倍。血清球蛋白水平和凝集试验正常。
（2）慢性活动性肝炎，它是一种进行性损伤性肝炎，其特点是肝小叶结构紊乱，最终可导致肝硬化，该病可能发生于HBV急性感染之后，也可能是隐匿起病。HBsAg阳性慢性活动性肝炎的临床表现可能是多种多样的，但转氨酶持续性升高是常见的现象，临床症状包括疲倦、食欲不振，有些病患从症状持续到后期，直到出现门静脉高压。
（3）慢性Obular肝炎，其特点是急性肝炎反复发作，发作间隙期无症状，病理学上类似于急性肝炎和非进行肝炎。