从扁形动物门开始，在外胚层和内层胚之间出现了中胚层。中胚层的出现对动物体结构与机能的进一步发展有很大意义。
（1）减轻了内、外胚层的负担，特别是运动机能的负担，引起了一系列的组织、器官系统的分化；
（2）促进了新陈代谢，增加了运动（肌肉层）、摄食、消化的功能，促进了排泄系统的形成；
（3）神经系统和感官向前集中；
（4）取代了内、外胚层的生殖机能，有了固定的生殖腺和生殖管道，同时出现了交配和体内受精的现象；
（5）中胚层形成实质组织，可贮存养料、水分、耐饥饿、抗干旱，是动物由水生进化到陆生的基本条件之一。