合同的变更原则上向将来发生效力，未变更的权利义务继续有效，已经履行的债务仍然有效.
合同的变更以原合同关系的存在为前提，变更部分不超出原合同关系之外.原合同关系有对价关系的仍保有同时履行抗辩权，原合同债权所有的利益与瑕疵仍继续存在，只是在增加债务人负担的情况下，非经保证人或物上担保人同意，保证不生效力，物的担保不及于扩张的债权价值额.
合同的变更不影响当事人要求赔偿损失的权利.《民法通则》第115条规定：“合同变更或者解除，不影响当事人要求损害赔偿的权利.”在合同变更以前，由于一方的过错而给另一方造成的损失，如果双方当事人没有对此另有约定，在合同变更以后，受损失的一方仍然有权请求过错方进行损害赔偿.
根据《合同法》第78条的规定，当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更.