微生物是存在于自然界中一群体积微小、结构简单、肉眼看不见，必须借助于光学显微镜或电子显微镜放大几百倍或几万倍才能观察到的微小生物。微生物的种类繁多，自然界存在的微生物达数十万种以上。根据微生物有无细胞基本结构、分化程度、化学组成等特点，可分为三大类。
（1）非细胞型微生物：无细胞结构，无产生能量的酶系统，由单一核酸（RNA或DNA.和蛋白质衣壳组成，具有严格的活细胞内寄生性。病毒属此类微生物。
（2）原核细胞型微生物：细胞核分化程度低，只有DNA盘绕而成的拟核，无核仁和核膜。除核糖体外，无其他细胞器。这类微生物包括细菌、衣原体、支原体、立克次体、螺旋体和放线菌。
（3）真核细胞型微生物：细胞核的分化程度高，有核膜、核仁和染色体，胞浆内有多种细胞器（如内质网、高尔基体、线粒体等），真菌属此类微生物。