在对自闭症个体的研究中，一些研究者把重点放在心里理论的特殊缺失上，令一些研究者则引入神经心理学的一个概念—执行功能，认为自闭症个体表现出的一些特征性障碍与执行功能的缺失关系密切。
执行功能是个体成功地从事独立的、有目的的、自我负责地行为能力，包括目标形成、策划过程、完成目标导向地计划和有效操作成分，规则使用在其中起着重要作用。自闭症患者地仿说、反复性地思考和动作、缺少计划、难以抑制不适当地反应等，都符合执行功能缺陷地假说，但只能间接解释自闭症患者的社交及沟通障碍。