1.哲学的物质范畴是各种具体物质形态的总和的一种抽象
自然科学关于物质则强调于比如原子、质子等只是某种具体物质形态。
可见自然科学的“物质”隶属于哲学的“物质”，只是其一个小部分
2.两者是抽象和具体的关系，是对立统一的辩证关系。从哲学的角度来看，哲学中所指的物质不是某种具体的物质，而是指物质的客观实在性，即物质的存在是不以人的意志为转移的，这就要求我们做任何事都要从实际出发，实事求是，具体情况具体分析。
3.在某些哲学概念中，也有重合的部分，比如：
①古代朴素唯物主义：寻求万物的“始基”即具体的物质形态
②近代形而上学唯物主义：寻求万物的“始基”即具体的物质层次——原子
①是共性与个性的关系
②哲学上的物质指感官可感知的，许多不同的事物的共同属性，是从各种物的总和中抽象出来的概念；自然科学的物质结构是具体的感官可感的事物，是个性。