天然质粒往往存在着缺陷，因而不适合用作基因工程的载体，必须对之进行改造构建：
A.加入合适的选择标记基因，如两个以上，易于用作选择，通常是抗生素基因。
B.增加或减少合适的酶切位点，便于重组。
C.缩短长度，切去不必要的片段，提高导入效率，增加装载量。
D.改变复制子，变严紧为松弛，变少拷贝为多拷贝。E.根据基因工程的特殊要求加装特殊的基因元件

相同点：有模板都需要模板原料酶和能量都在细胞内进行。
不同点：前者模板是一条后者两条前者原料是核糖核苷酸后者是脱氧核苷酸。

顺式作用元件对基因表达起调控作用的过程。