维生素、氨基酸或嘌呤（嘧啶）通常作为酶的辅基或辅酶，以及用于合成蛋白质、核酸，是微生物生长所必需且需要量很小，而微生物（如营养缺陷型菌株）自身不能合成或合成量不足以满足机体生长需要的有机化合物。而葡萄糖通常作为碳源和能源物质被微生物利用，需要量较大，而且其他一些糖类等碳源物质也可以代替葡萄糖满足微生物生长所需。

以有机碳化合物为能源，碳源和供氢体也是有机碳化合物的微生物。

利用无机化合物氧化过程中释放的能量和以CO2为碳源生长的微生物。

利用光作为能源，以CO2为基本碳源，供氢体是还原在无机化合物的微生物。

以光为能源，以有机碳化合物作为碳源和供氢体营光合生长的微生物。

大多数微生物属此类型，它们生长的碳源和能源均来自有机物。大肠杆菌即属此类。