是确定界标或基因在构成基因组的每条染色体上的位置，以及同条染色体上各个界标或基因之间的相对距离。

其标志是大规模基因组分析、蛋白质组分析以及各种数据的比较和整合。

这种方法引入某些形式的分类系统，从而将表达模式分配到一个或多个预定义的类目中。

这种方法没有内建的分类标准，组的数目和类型只决定于所使用的算法和数据本身的分析方法。

一种通过将相似的数据划分到特定的组中以简化大规模数据集的方法。

由位点产生的突变数目把其中的一课树与其他树区分开的位点。