也称专能、偏能干细胞，这类干细胞只能向一种类型或密切相关的两种类型的细胞分化，如上皮组织基底层的干细胞、肌肉中的成肌细胞。单能干细胞是发育等级最低的干细胞。

能够发育成为具有各种组织器官的完整个体潜能的细胞，如胚胎干细胞。

发育过程中体态的改变。如果蝇的幼虫发育成成虫时的形态与幼虫完全不同，蛙从蝌蚪发育成成蛙也发生了形态的改变。

由同源框编码的60个氨基酸序列，被称为同源异型结构域。