是基因活性调节的一种方式。这种调节主要是根据DNA片段在基因组中位置的变化，即从一个位置变换到另一个位置，从而改变基因的活性。最熟知的两个例子是酵母交配型的控制和抗体基因的重排。

mRNA前体通过不同的剪接方式产生不同的成熟mRNA，从而产生不同的蛋白质。

有不同性别的亲代传给子代的同一染色体或基因，可以引起不同的表型。

将在DNA水平上调节基因的活性称为基因组控制，其中两种重要的方式是DNA的甲基化和DNA重排。