（1）养分含量：有机肥低，化肥高；（2）养分种类：有机肥全面，化肥单纯；（3）养分释放速度：有机肥慢，化肥快；（4）肥效：有机肥较长，化肥短暂；（5）有机肥可改良土壤，有些化肥长期施用后会影响土质，化肥（尤其是氮肥）还会对生态环境造成不利影响。

施入土壤后，由于植物选择性吸收导致土壤变碱的肥料。

污染地下水，造成水体的富营养化；污染大气，破坏臭氧层，使进入地球表面的紫外线增多；造成温室气体效应等。

（1）氨的挥发损失；（2）硝酸盐的淋溶损失；（3）硝酸盐的反硝化脱氮损失。