又称停止转运信号（halt  transfer  signal），它是存在于新生肽中能够使肽链通过膜转移停止的一段信号序列，结果导致蛋白质锚定在膜的双脂层，停止转运信号以α螺旋的形式锚定在双脂层。因停止转移信号的作用而形成单次跨膜的蛋白，那么该蛋白在结构上只有一个停止转移信号序列，没有内含转移信号，但在N-端有一个信号序列作为转移起始信号。