质子跨过内膜向膜间隙的转运也是一个生电作用（electro  genesis），即电压生成的过程。因为质子跨膜转运使得膜间隙积累了大量的质子，建立了质子梯度。由于膜间隙质子梯度的建立，使内膜两侧发生两个显著的变化∶线粒体膜间隙产生大量的正电荷，而线粒体基质产生大量的负电荷，使内膜两侧形成电位差；第二是两侧氢离子浓度的不同因而产生pH梯度（ΔpH），这两种梯度合称为电化学梯度（electrochemical   gradient）。线粒体内膜两侧电化学梯度的建立，能够形成质子运动力（proton-motive  force，Δp），只要有合适的条件即可转变成化学能储存起来。

又称电子传递链，是线粒体内膜上一组酶的复合体。其功能是进行电子传递，H+的传递及氧的利用，最后产生H2O和ATP。