核仁主要由rDNA、rRNA、RNP和相关酶及蛋白组成。超微结构包括纤维中心、致密纤维组分及颗粒相分。
核仁的主要功能与核糖体的生物发生相关，其中纤维中心是rRNA基因的储存位点；纤维中心与致密纤维组分的交界处发生rRNA初始转录及加工；而颗粒组分则是核糖体亚单位装配、成熟和存储位点。另外，核仁还参与mRNA的输出与降解。

在果蝇个体发育的某个阶段，多线染色体的某些带区变得疏松膨大而形成的胀泡，是基因活跃转录的标志。

可遗传的、与核酸序列没有直接关系的控制基因活性的调控方式。

在染色体包装时，为染色质提供锚定位点的非组蛋白。