细胞质核糖体上合成的线粒体蛋白运送至线粒体时，多以前体存在，尤其成熟蛋白质和N端的一段导肽共同组成。导肽识别线粒体表面的受体，在外膜上GIP蛋白的参与下引导蛋白有内外膜的接触点通过内膜，导肽最终被水解酶切除。前体蛋白在跨膜运送时，分子伴侣协助其从折叠状态转变为解折叠状态，利于跨膜。前体蛋白再通过内膜后，再重新折叠为成熟的蛋白质。蛋白质进入线粒体特定部位时所需的信号序列如下。进入外膜的蛋白
（1）具有不被切除的N端信号序列，其后还有疏水的停止转义序列，蛋白质被转运复合体安装到外膜上。
（2）进入线粒体内膜和膜间隙的蛋白
1、蛋白N端具有两个信号序列，先被运送到基质，然后N端导肽被切除，暴露出第二段导向内膜的信号序列，再插入内膜。若信号序列被内膜外表面的异二聚体内膜蛋白酶切除，则成为膜间隙的蛋白。
2、N端信号序列的后面有一段疏水停止转移序列，能与膜上的通道复合体结合，当进入基质的信号序列被切除后，脱离转位因子复合体而进入内膜，如果插入膜中的部分又被酶切除，则成为定位于膜间隙的蛋白。
3、线粒体内膜上负责代谢底物产物转运的蛋白，如腺苷转位酶是多次跨膜蛋白，其N端没有可被切除的信号序列，但包含3~6个内部信号序列，可被TIM22复合体插到内膜上。

是一类含非血红素铁的蛋白质。在铁硫蛋白分子的中央结合的是铁和硫。