可以利用阴阳树脂密度不同，借自下而上水流分离的方法将它们分开。另一种方法是将混杂树脂浸泡在饱和食盐水或16%左右的NaOH溶液中，阴树脂就会浮起来，阳树脂则不然。如果两种树脂密度差很小，则可先将树脂转型，然后再进行分离，因为树脂的类型不同，其密度也发生变化。
例如：OH型阴树脂密度小于CL型，阴树脂先转成OH型后，就易和阳树脂分离。