1、鉴定宝石的种类：有些宝石中含有特定的包裹体，这些包裹体可以帮助我们鉴定宝石的种类；
2、区分天然、合成及仿制宝石：天然保湿和合成宝石在格子的生长过程中都留下了生长痕迹，根据生长痕迹能有效的区分它们；
3、检测某些人工优化处理的宝石：宝石优化处理方法很多，每个宝石可以有几种方法对其颜色、外观进行改善，在进行这些改善的同时，会造成新的内含物特征，给鉴定提供依据；
4、宝石质量和价格的评价：内含物的多少、颜色的深浅、颗粒大小和分布状况等都对宝石的品质起着重要作用。内含物的特征可以帮助判断宝石品质的高低；
6、指导加工：根据内含物在宝石中所处的位置、数量、大小和分布状态等特点来指导加工，确定加工款式，保证多加工出的宝石能产出最大的经济价值。
5、了解宝石形成的环境：研究宝石的内含物，可以帮助了解宝石形成的环境，如生长温度、压力、介质成分等，还可以通过对内含物的同位素年龄测定了解宝石形成的地质年代；