溶解氧：好氧生物处理必须有充分的氧气供应。
酸碱度：对于好氧生物处理，pH控制在6-9；对于厌氧生物处理，pH控制在6.5-7.5。
温度：大多数细菌的适宜温度为20-40°C。
有毒物质：废水中不能含有过多的有毒物质，多数重金属如锌、铜、铅、铬离子有毒性，某些非金属物质如酚、甲醛、硫化物也有毒性。这些有毒物质能抑制其他物质的生物氧化过程，废水中也不能含有过多的油类物质。
养料：微生物的繁殖必须要有各种养料，其中包括碳、氮、磷、硫，微量的钾、钙、镁、铁等和维生素。不同的微生物对每一种营养元素的数量要求是不同的。