赤潮是一种自然生态现象，相当一部分赤潮是无害的，它们自生自灭，然而，近年来赤潮频繁发生和规模不断扩大，其危害引起人们高度重视。
主要危害有：
（1）赤潮生物大量繁殖，覆盖海面或附着在鱼、贝类的鳃上，使它们的呼吸器官难以正常发挥作用而造成呼吸困难甚至死亡；
（2）赤潮生物在生长繁殖的代谢过程和死亡细胞被微生物分解的过程中大量消耗海水的溶解氧，使海水严重缺氧，海洋动物因缺氧而窒息死亡；
（3）有些赤潮生物体内及其代谢产物含有生物毒素，引起海洋动物中毒或死亡；
（4）居民通过摄食中毒的鱼、贝类而产生中毒。目前已知的赤潮毒素有麻痹性贝毒、神经性贝毒和泻痢性贝毒等三大类；
（5）引起海洋异变，局部中断海洋食物链，使海域一度成为死海。

组成变化类型、结构变化类型、功能变化类型、基因突变类型、个体毒害类型、生理变化类型、综合变化类型。

进入海洋环境中的污染物质发生的生态学过程主要包括：混合、扩散、溶解与沉淀、吸附、络合、转化、降解、生物吸收等过程