阻止黏附，协助杀菌：与黏蛋白一起形成保护膜，减少微生物的黏附；增强溶菌酶和乳铁蛋白的杀菌能力
抗原调节和免疫排斥：调节黏膜抗原摄取；口腔耐受：机体血清免疫对经口摄入抗原的不应答性；清除抗原。

有特定的识别序列，通常为4-6个碱基对。切割点位于识别序列内的固定位置上。酶切后形成粘性末端或平齐末端。

分离已知基因；检测微量DNA；遗传性疾病、肿瘤的诊断。