急性菌痢应与阿米巴性痢疾相鉴别，鉴别要点有：
①阿米巴性痢疾多为散发，常无发热，一般无里急后重。
②排便情况，较急性痢疾次数少，量较多，常呈果酱样。
③腹部压痛较轻，多在右下腹。
④粪便中可找到溶组织阿米巴滋养体及其包囊。