牙菌斑形成过程分为三个阶段：
牙面上获得性薄膜的覆盖，菌斑形成的初始为牙面上覆盖一薄层来自唾液糖蛋白的薄膜。在牙面清洁后，唾液的一些成分会很快地吸附于其上而形成一层均匀无细胞的薄膜，厚度约1～10um，龈缘区较厚而牙尖区较薄，成分大致与唾液相似，对细菌有选择性吸附能力。
细菌附着，细菌通过其表面蛋白、脂磷壁酸、多糖黏附和聚集在牙表面获得性薄膜。
菌斑成熟，当纤毛菌定植于菌斑后替代了原先栖息在菌斑深层的链球菌并与牙面垂直排列成栅栏状结构，使菌
斑内氧含量减少，氧化还原电势降低而更有利于厌氧菌的生长。一般认为成熟菌斑的标志是栅栏状结构，约出现在菌斑形成的5~6天，可见谷穗样结构，在成熟菌斑内无论细菌的数量或组成比例均趋于问鼎的极期群落状态。