P-type：转运中泵蛋白需要磷酸化/去磷酸化（P是phosphorylation的缩写），利用发生构象的改变来转移离子。包括Na⁺-K⁺泵、Ca²⁺泵。
V-型质子泵：又称膜泡质子泵，利用ATP水解供能从细胞质基质中逆H＋电化学梯度泵出H⁺进入细胞器，以维持细胞质基质pH中性和细胞器内pH酸性。存在于动物细胞胞内体、溶酶体膜、破骨细胞和某些肾小管的质膜以及植物、酵母和其他真菌细胞液泡膜上。 
F-型质子泵：又称H⁺－ATP合成酶（F1F0－ATPase），存在于线粒体内膜、植物细胞类囊体膜和细菌质膜上，H⁺顺浓度梯度运动，所释放的能量耦联ATP合成。如线粒体磷酸化和叶绿体光合磷酸化。

P－型离子泵、V－型质子泵、F－型质子泵和ABC超家族。