（1）样品制备，包括蛋白质的溶解、变性、还原以及去除蛋白质杂质等。
（2）固相pH值梯度胶（IPG）胶的制备，利用不同pH固定化电解质的组合可配制不同pH范围的凝胶。
（3）双向电泳，先作第一向电泳，再进行第二向电泳。
（4）蛋白质的染色，主要根据上样量的多少及样品进一步分析要求等加以选择，常用的方法有考马斯亮蓝染色、银染、铜染等。

蛋白质组是指一种基因组所表达的全套蛋白质，即包括一个细胞或一个组织或一个机体的基因所表达的全部蛋白质。

基因组是一个细胞或一种生物体的整套遗传物质。包括原核生物基因组和真核生物基因组。

包括基因突变的检测、基因定位、基因表达异常的检测、感染微生物的检测以及法医学的检测。

基因诊断是指通过直接检测目的基因或该基因的转录产物的存在状态，从而对疾病作出诊断的方法。