（一）目标全球消灭疟疾是防治的最终目标，但要经历漫长的历史时期。我国要在短期内达到消除疟疾的目标。
疟疾防治过程大体可为四个阶段。
第一阶段为降低发病率阶段，其目标应是降低发病率和病死率，控制暴发流行，减轻危害程度；
第二阶段为控制流行阶段，其目标应是进一步降低发病率，逐步控制流行，使年发病率降至并稳定在低水平，如1／万以下，防止暴发流行；
第三阶段为消除疟疾阶段，其目标应是阻断疟疾的传播，因可能还有残存病例和输入病例，所以要防止继发感染病例发生，使疟疾不再成为当地严重的公共卫生问题；
第四阶段为巩固阶段，其目标应是巩固消除疟疾的成果。
（二）防治策略在政府统一领导下，把疟疾防治工作纳入社会经济发展的总体规划，根据不同地区、不同时期的流行病学特点，因时、因地制宜，实行分类指导，依靠科技进步，采取以传染源监测控制、媒介防制、人群防护和环境改造等相结合的综合性防治策略措施，动员社会各方面的力量，全面落实各项措施，通过不懈防治，逐步降低发病率，控制流行，达到消除和最终消灭疟疾的目标。