肠道正常菌群对机体的有益作用有：
①生物拮抗作用：肠道正常菌群中，大部分为厌氧菌，具有很强的黏附作用，长期牢固地黏附于肠黏膜表面，形成一道生物屏障，从而阻止了致病菌的入侵。
②营养作用：肠道正常菌群参与宿主的物质代谢、营养转化和合成。
③免疫作用：肠道正常菌群作为非特异性抗原对机体发挥其免疫作用。
④抗衰老作用：正常菌群中的双歧杆菌可阻止产生有害物质（HS、吲哚等）的芽孢杆菌增多，这些物质可加速机体的衰老过程。
⑤抑制肿瘤作用：肠道正常菌群可转化某些致癌物质成为非致癌物质，亦可激活巨噬细胞等的免疫功能。