万全的儿科专著有《幼科发挥》、《育婴家秘》、《痘疹心法》、《片玉心书》等。他的主要学术观点有：
①倡导“预养以培其元、胎养以保其真、蓐养以防其变、鞠养以慎其疾”的“育婴四法”。
②在朱丹溪的学术基础上，系统提出了“三有余、四不足”的小儿生理病理学说，即阳常有余、阴常不足，肝常有余、脾常不足，心常有余、肺常不足，肾常虚。
③对痘疹、麻疹、惊风等病症有独到见解，提出了痘疹治疗应"温补凉泻，各随所意"的观点。
④在治疗上首重保护胃气，提出五脏以胃气为本，赖其滋养。主张儿科用药讲究精练。
⑤首次将推拿法应用于儿科。